De DGO heeft tot doel het leveren van gezondheidszorg voor militairen, familieleden van in het buitenland geplaatste defensiemedewerkers, verzekeringsgeneeskunde voor militairen en oud-militairen, GGZ en revalidatiezorg aan civiele cliënten, inclusief veteranen, bedrijfsgezondheidszorg voor alle medewerkers van Defensie, het verzorgen van opleidingen, trainingsondersteuning, kennisproducten, specialistenteams en -medewerkers voor de OPCOs, expertise, arbodienstverlening en materieellogistiek voor het geneeskundig assortiment.
De DGO houdt daarbij rekening met de voorziening van humanitaire hulp aan noodlijdende partijen en kan, indien gewenst/opgedragen, zo nodig voorzien in geneeskundige dienstverlening/ondersteuning van civiele autoriteiten.
De DGO bestaat uit verschillende onderdelen die tezamen alle bovenstaande activiteiten leveren. Deze functie bevindt zich binnen de staf van DGO. Daarnaast zijn er nog de bedrijven: Bijzondere Medische Beoordelingen, het Coördinatiecentrum Expertise Arbeidsomstandigheden en Gezondheid, het Centraal Militair Hospitaal, het Defensie Gezondheidszorg Opleidings- & Trainingscentrum, de Defensie Tandheelkundige Dienst, het Eerstelijns Gezondheidszorg Bedrijf, het Instituut samenwerking Defensie en Relatieziekenhuizen, het Militair Geneeskundig Logistiek Centrum, het Militair Revalidatie Centrum en de Militaire Geestelijke Gezondheidszorg.
De staf DGO bestaat uit de Commandogroep, de sectie kwaliteitszorg, de sectie advies en assistentie medisch personeel, de afdeling Internationale Samenwerking & Innovatie (IS&I), de sectie duurzaam gezond inzetbaar, de afdeling Operationele Militaire Gezondheidszorg (OMG), de afdeling Reguliere Militaire Gezondheidszorg (RMG), de afdeling Bedrijfsvoering (BV), de afdeling Medisch Informatiemanagement (MIM), en de afdeling Financiële Militaire Gezondheidszorgexpertise (FMG). Tezamen zorgen zij voor de randvoorwaarden om de juiste
gezondheidszorg te kunnen leveren.